특이한 에러

가끔 이런 뜬금없는 에러가 뜨는데,

===================================================================================
=   BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES
=   RANK 0 PID 3880668 RUNNING AT HP-Z8
=   KILLED BY SIGNAL: 11 (Segmentation fault)
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===================================================================================
=   BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES
=   RANK 1 PID 3880669 RUNNING AT HP-Z8
=   KILLED BY SIGNAL: 9 (Killed)
===================================================================================

 

이렇게 도메인 디컴퍼지션을 하는경우 생긴다.

processors       1 1 2
region           domain_3D block -0.015 0.015 -0.015 0.015 -0.015 0.04

 

정확한 이유는 모르겠으나, 나는 z 방향 region이 symmetric 하지 않아 발생하는 것이라 추정한다.

그래서 아래와 같이 수정하면 된다.

 

processors       1 1 2
region           domain_3D block -0.015 0.015 -0.015 0.015 -0.015 0.015

 

또는 아래와 같이 symmetric한 축으로 도메인을 나누면 되더라.

 

processors       2 2 1
region           domain_3D block -0.015 0.015 -0.015 0.015 -0.015 0.04

 

 

그런데 이게 특이한게, clump fix에 중력가속도를 직접 때려 넣으면 발생하는 에러라서, lammps 포럼에 보고하기도 짜치고 그렇다.

fix              make_clumps_1 all rigid/small/omp molecule mol clumps_01 gravity grav_acc

 

그런데 clumps는 이렇게 중력 가속도를 때려 넣어야 워닝이 안발생한다는 사실